通过表达分析鉴定与PAK CHOI中花卉器官发育相关的基因。
抽象的
Pak Choi是一种高度营养丰富的蔬菜,在中国,东南亚和世界其他地区广泛种植。因为它通过种子繁殖,所以了解花器官发育的机制非常重要。因此,使用中国卷心菜基因组作为参考,本研究分析了花蕾分化阶段和第5阶段的芽顶基因的表达谱,以鉴定与花器官发育有关的基因。结果表明,映射基因的比例很高,其中有84.25%和83.80%的清洁读物分别从分析到参考基因组。总共确定了525个差异表达的基因(DEG),其中224个上调,301个被下调。在第1阶段和第5阶段还分析了与中国白菜开花基因同源的基因的表达水平。BRA012997(AP1),BRA000393(SOC1)和BRA004928(SOC1)的表达水平在第5阶段显着上调,这表明这三个基因在Pak Choi中阳性地调节花卉发育。用拟南芥的同源基因分析了参与花卉器官发育的DEG;同源基因BRA029281(AGL42),BRA026577(ARPN),BRA022954(SPL3),BRA029293(ARF2)(ARF2),BRA007978(ARF2),ATRLP12,BRA033221(BRA032221(SPLA)BRABRABRABRA 0088015151514(aTRA)(bra)AT4G21323),BRA025315(KLCR2)和BRA013906(DTX35)与拟南芥的花卉器官发育直接相关,这表明这些基因在PAK CHOI的花坛发育过程中具有相应的功能,并且可以作为进一步遗传研究的候选者。 These results provide a foundation for research on the molecular mechanism of flower organ development in pak choi and other Brassica rapa vegetables.